Bệnh rỉ sắt do nấm Phakopsora pachyrhizi gây ra là một trong những bệnh chính trên cây đậu nành (Glycine max) ở Châu Á và gây thiệt hại đáng kể về năng suất ở khắp các nước sản xuất đậu nành. Hầu hết các nước nhiệt đới và cận nhiệt đới đều ghi nhận có sự xuất hiện của bệnh rỉ sắt đậu nành địa phương (Sinclair, 1989). Ở Đài Loan, bệnh rỉ sắt có thể gây thiệt hại nghiêm trọng trên cây đậu nành không được bảo vệ bằng thuốc trị nấm và ở một số vùng, bệnh rỉ sắt là một yếu tố làm giới hạn việc sản xuất đậu nành vụ xuân.

Số trái và dạng trái đậu nành là hai yếu tố quan trọng có ảnh hưởng đến năng suất sau cùng của hạt.  Phương pháp phân tích “Fourier Elliptic” được sử dụng trong nghiên cứu này. Tám mươi giống đậu nành có nguồn gốc khác nhau được gieo từ  tháng 1 đến tháng 4/2010 tại tại lô đất thuộc Khu vực V, phường Hưng Thạnh, quận Cái Răng, thành phố Cần Thơ.

Với sự phát triển của công nghệ sinh học, diện tích cây trồng biến đổi gen ngày càng tăng, lên đến 134 triệu ha trong năm 2009, trong đó đậu tương biến đổi gen chiếm 76 triệu ha. Ở Việt Nam đậu tương là cây thực phẩm quan trọng, diện tích gia tăng từ 120.000 ha năm 1995 lên 200.000 ha năm 2009, với năng suất tương ứng tăng từ 1,0 lên 1,4 tấn/ha.

Bệnh héo xanh lạc, vừng do vi khuẩn Ralstonia solanacearum  đã gây ra nhiều thiệt hại cho người nông dân, theo thống kê khoảng 25 - 45% sản lượng. Nhiều loại thuốc hoá học bảo vệ thực vật  đã và  đang  được sử dụng, hiệu quả của nó  đối với một số bệnh là rất cao, nhưng chúng lại không có tác dụng  đối với bệnh héo xanh.

Trong những năm qua sản xuất lạc và đậu tương ở nước ta đã có bước tiến bộ nhảy vọt nhờ vào các thành tựu nghiên cứu khoa học các giai đoạn trước và giai đoạn 2006 - 2010, chính sách phát triển nông nghiệp của các cấp chính quyền từ trung ương đến địa phương.

Lạc, đậu tương, đậu xanh là 3 cây trồng chính trong nhóm cây đậu đỗ được khai thác để đáp ứng nhu cầu sử dụng dầu thực vật, protein cho người và nguyên liệu thức ăn gia súc, đây cũng là loại cây trồng có tác dụng tốt trong việc luân xen canh, cải tạo đất và ứng dụng để chuyển đổi cơ cấu cây trồng rất hiệu quả. Sản phẩm của đậu đỗ được sử dụng rất phổ biến trong dân gian và ngày càng được tiêu thụ nhiều hơn khi phát hiện được nhiều vi chất ảnh hưởng tốt đến sức khỏe con người và động vật.

Sâu cuốn lá lạc là đối tượng gây hại nghiêm trọng trên cây lạc, để quản lý sâu cuốn lá hại lạc đạt hiệu quả cao phải sử dụng biện pháp quản lý dịch hại tổng hợp với phương châm là giải quyết một cách hài hòa mối quan hệ giữa sâu hại, thiên địch, cây trồng và điều kiện ngoại cảnh ở từng giai đoạn sinh trưởng của cây lạc. Trong đó cần duy trì và khích lệ khả năng hoạt động của các loài thiên địch,

Để rút ngắn thời gian trong việc chọn tạo giống lạc kháng bệnh héo xanh vi khuẩn, ứng dụng chỉ thị phân tử là con đường ngắn và hiệu quả, không những góp phần hạn chế tác hại của bệnh mà còn hạn chế sử dụng thuốc bảo vệ thực vật phòng chống bệnh, bảo vệ môi trường và tạo sự đa dạng sinh học đối với cây lạc (Liao et al., 2005b; Peng et al., 2011; Ding et al., 2012). Đến nay ở nước ta chưa có nghiên cứu nào về sử dụng chỉ thị phân tử để chọn giống lạc kháng bệnh héo xanh vi khuẩn được công bố.

Sự gia tăng dân số một cách nhanh chóng làm cho vấn đề an ninh lương thực trở thành vấn đề chính của thế giới nói chung và Việt Nam nói riêng. Thêm vào đó, sản lượng và sự phát triển của nền sản xuất nông nghiệp bền vững cũng đang bị đe dọa bởi ảnh hưởng của hiện tượng biến đối khí hậu và các điều kiện bất lợi (như hạn, ngập úng, dịch bệnh, sói mòn đất và ô nhiễm môi trường).