Chào mừng Quý độc giả đến với trang thông tin điện tử của Viện Khoa học Kỹ thuật Nông nghiệp miền Nam

Tin nổi bật
Thành tích

Huân chương Ðộc lập

- Hạng 1 - Hạng 2 - Hạng 3

Huân chương Lao động

- Hạng 1 - Hạng 2 - Hạng 3

Giải thưởng Nhà nước

- Nghiên cứu dinh dưởng và thức ăn gia súc (2005)

- Nghiên cứu chọn tạo và phát triển giống lúa mới cho xuất khẩu và tiêu dùng nội địa (2005)

Giải thưởng VIFOTEC

- Giống ngô lai đơn V2002 (2003)

- Kỹ thuật ghép cà chua chống bệnh héo rũ vi khuẩn (2005)

- Giống Sắn KM 140 (2010)

Trung tâm
Liên kết website
lịch việt
Thư viện ảnh
Video
Trung Tâm NC Khoai tây, Rau và Hoa, trồng rau Hàn Quốc theo VietGap

Thống kê truy cập
 Đang trực tuyến :  17
 Số lượt truy cập :  29621552
Phân tích phiên mã độ dài đầy đủ của cùng bộ gen đậu tương với các phản ứng tương thích và không tương thích với heterodera glycines cho thấy lây nhiễm tuyến trùng kích hoạt phản ứng bảo vệ của thực vật
Thứ bảy, 25-06-2022 | 05:31:37

Minghui Huang(1), Ye Jiang(1,2), Ruifeng Qin(1,2), Dan Jiang(1,2), Doudou Chang(1,2), Zhongyan Tian(2), Chunjie Li(1) và Congli Wang(1)

Võ Như Cầm biên dịch

TÓM TẮT

Giải trình tự phiên mã có độ dài đầy đủ với các bài đọc dài là một công cụ mạnh mẽ để phân tích các sự kiện phiên mã và sau phiên mã; tuy nhiên, nó đã không được áp dụng trên đậu tương (Glycine max). Ở đây, một phân tích phiên mã tương đối có chiều dài đầy đủ được thực hiện trên kiểu gen đậu tương 09-138 bị nhiễm tuyến trùng nang đậu tương (SCN, Heterodera glycines) chủng 4 (SCN4, phản ứng không tương thích) và chủng 5 (SCN5, phản ứng tương thích) bằng cách sử dụng Công nghệ Oxford Nanopore. Mỗi mẫu trong số 9 mẫu có chiều dài đầy đủ được thu thập 8 ngày sau khi cấy có/không có tuyến trùng tạo ra trung bình 6,1Gb dữ liệu sạch và tổng số 65.038 trình tự phiên mã. Sau khi loại bỏ các bản sao thừa, 1.117 gen mới và 41.096 bản sao mới đã được xác định. Bằng cách phân tích cấu trúc trình tự của các bản sao mới lạ, có tổng cộng 28.759 trình tự khung đọc mở (ORF) hoàn chỉnh, 5.337 yếu tố phiên mã, 288 RNA dài không mã hóa và 40.090 phiên mã mới với chú thích chức năng đã được dự đoán. Gene Ontology (GO) và Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) phân tích làm giàu các gen biểu hiện khác biệt (DEG) cho thấy rằng hormone tăng trưởng, con đường tín hiệu được kích hoạt bởi auxin và tăng trưởng tế bào đa chiều, và con đường sinh tổng hợp phenylpropanoid được làm giàu bằng cách nhiễm cả hai chủng tuyến trùng. Nhiều DEG liên quan đến các yếu tố phản ứng với căng thẳng, con đường dẫn truyền tín hiệu hormone-thực vật và con đường tương tác giữa thực vật - mầm bệnh với nhiều điều chỉnh hơn được phát hiện trong phản ứng không tương thích với lây nhiễm SCN4 và phát hiện nhiều DEG có điều chỉnh liên quan đến quá trình biến đổi thành tế bào và xử lý sinh học carbohydrate trong phản ứng tương thích với lây nhiễm SCN5 khi so sánh với nhau. Trong số đó, các DEG chồng chéo với sự khác biệt về số lượng đã được kích hoạt. Sự kết hợp tương tác giữa protein-protein với DEGs lần đầu tiên chỉ ra rằng nhiễm tuyến trùng đã kích hoạt tương tác giữa yếu tố phiên mã WRKY và VQ (valine-glutamine motif) để góp phần bảo vệ đậu tương. Kiến thức về cơ chế tương tác SCN-đậu tương làm mô hình sẽ giúp hiểu rõ hơn về các tương tác khác giữa thực vật và tuyến trùng.

 

Từ khóa: giải trình tự phiên mã chiều dài đầy đủ, glycine max, Heterodera glycines, phản ứng tương thích và không tương thích, tương tác VQ – WRKY

 

Chi tiết xin xem tệp đính kèm!


1Phòng thí nghiệm Key về chọn giống thiết kế phân tử đậu tương, Viện Địa lý và Nông học Đông Bắc, Học viện Khoa học Trung Quốc, Cáp Nhĩ Tân, Trung Quốc

2Học viện Khoa học Nông nghiệp Hắc Long Giang, Đại Khánh, Trung Quốc

Trở lại      Tải file      In      Số lần xem: 106

[ Tin tức liên quan ]___________________________________________________
  • Nghiên cứu đa dạng di truyền vi khuẩn Ralstonia solanacearum Smith gây bệnh héo xanh hại lạc và xác định các dòng, giống kháng bệnh ở một số tỉnh miền Bắc Việt Nam ( Thứ hai, 25/04/2016 )
  • Bệnh rỉ sắt đậu nành ( Thứ năm, 01/05/2014 )
  • Nghiên cứu vai trò của các yếu tố phiên mã đáp ứng auxin (GmARF) ở đậu tương và strigolactone ở arabidopsis trong chịu hạn và mặn ( Thứ tư, 20/07/2016 )
  • Sử dụng phương pháp nuôi cấy trên lá trong chọn giống đậu tương kháng Cercospora Kikuchii ( Thứ bảy, 15/01/2022 )
  • Lập bản đồ locus tính trạng số lượng về tính chịu ngập úng ở giai đoạn đầu của quần thể dòng tái tổ hợp đậu tương ( Thứ ba, 14/12/2021 )
  • Lập bản đồ qũy tích các tính trạng số lượng về khả năng chịu hạn trong quần thể dòng lai tái tổ hợp đậu tương ( Thứ năm, 09/12/2021 )
  • Lập bản đồ QTL và phân tích gen ứng cử viên cho tính chống chịu tách quả ở đậu tương (GLYCINE MAX) ( Thứ hai, 06/12/2021 )
  • Xác định QTL cho khả năng chống chịu với ngập úng ở giai đoạn cây con của đậu tương (Glycine max L. MERR.) ( Thứ năm, 02/12/2021 )
  • Phân tích các gen biểu hiện khác biệt trong mô lá đậu tương của các giống chống chịu và mẫn cảm với ngập úng đã biểu hiện bằng cách giải trình tự RNA ( Thứ hai, 29/11/2021 )
  • Nghiên cứu tuổi thọ của hạt đậu tương hoang dại, đậu tương trồng và các dòng lai tái tổ hợp (RILS) ( Thứ hai, 29/11/2021 )
  • Phân tích biến dị di truyền ở dạng và số trái đậu nành bằng phương pháp đường viên ( Thứ năm, 01/05/2014 )
  • Chọn tạo giống đậu tương biến đổi gen kháng sâu ở Việt Nam ( Thứ năm, 01/05/2014 )
  • Hiệu quả chủng vi khuẩn cố định đạm (Sinorhizobium fredii) và hòa tan lân (Pseudomonas stutzeri) dạng lỏng đối với đậu nành trồng trên nền đất lúa ở ĐBSCL ( Thứ năm, 01/05/2014 )
  • Sản xuất và đánh giá chế phẩm vi sinh đối kháng phòng bệnh héo xanh lạc, vừng ( Thứ tư, 17/02/2016 )
  • Nghiên cứu chọn tạo giống lạc, đậu tương cho các tỉnh phía Bắc ( Thứ năm, 24/09/2015 )
  • Cây đậu đỗ ở các tỉnh phía Nam - Thực trạng và định hướng phát triển ( Chủ nhật, 15/11/2015 )
  • Nghiên cứu một số biện pháp kỹ thuật quản lý sâu cuốn lá hại Lạc vụ xuân 2013, tại xã Hải Lĩnh, huyện Tỉnh Gia, tỉnh Thanh Hóa ( Thứ hai, 07/03/2016 )
  • Đánh giá tác động của nano kim loại (sắt, đồng, coban) đến giống đậu tương HLĐN 29 ở Đồng Nai ( Thứ tư, 16/09/2020 )
  • Ảnh hưởng của thời gian gây úng đến sinh trưởng, sinh lý và năng suất của đậu xanh trong điều kiện nhà lưới ( Thứ ba, 22/09/2020 )
  • Phân tích vai trò của gốc methionine trong cấu trúc họ nhân tố phiên mã ở đậu tương ( Thứ tư, 23/09/2020 )
Designed & Powered by WEBSO CO.,LTD