Chào mừng Quý độc giả đến với trang thông tin điện tử của Viện Khoa học Kỹ thuật Nông nghiệp miền Nam

Tin nổi bật
Thành tích

Huân chương Ðộc lập

- Hạng 1 - Hạng 2 - Hạng 3

Huân chương Lao động

- Hạng 1 - Hạng 2 - Hạng 3

Giải thưởng Nhà nước

- Nghiên cứu dinh dưởng và thức ăn gia súc (2005)

- Nghiên cứu chọn tạo và phát triển giống lúa mới cho xuất khẩu và tiêu dùng nội địa (2005)

Giải thưởng VIFOTEC

- Giống ngô lai đơn V2002 (2003)

- Kỹ thuật ghép cà chua chống bệnh héo rũ vi khuẩn (2005)

- Giống Sắn KM 140 (2010)

Trung tâm
Liên kết website
lịch việt
Thư viện ảnh
Video
Thiết lập chuỗi giá trị nông sản thông minh và an toàn tại Việt Nam Cà chua bi

Thống kê truy cập
 Đang trực tuyến :  13
 Số lượt truy cập :  33212112
Khác biệt về địa lý và biến thiên chuỗi trình tự tại domain đặc biệt của những alen của gen Pib kháng bệnh đạo ôn lúa
Thứ sáu, 29-07-2016 | 08:24:33

Nguồn: Vasudevan K, Vera Cruz CM, Gruissem W, Bhullar NK. 2016. Geographically Distinct and Domain-Specific Sequence Variations in the Alleles of Rice Blast Resistance Gene Pib. Front Plant Sci. 2016 Jun 23;7:915. doi: 10.3389/fpls.2016.00915. eCollection 2016.

TÓM TẮT

Bệnh đạo ôn trên lúa do nấm Magnaporthe oryzae  gây ra với ảnh hưởng rất nghiêm trọng cho sản xuất lúa trên toàn thế giới. Gen kháng Pib có phổ kháng bệnh rất rộngvới các nòi địa lý (races) thuộc vùng Đông Nam Á. Người ta nghiên cứu khác biệt di truyền của những alen của gen Pib trong ngân hàng gen cây lúa có nguồn gốc từ 12 vùng trồng lúa chủ lực của thế giới. Hai mươi lăm alen mới của gen Pib đã được xác định, chúng có những SNPs (single nucleotide polymorphisms) độc nhất, với những chèn đoạn/hoặc mất đoạn (InDels), bên cạnh đó là những nucleotides có tính chất đa hình. Chúng chia sẻ giữa những alen khác nhau. Những nucleotides có tính đa hình được chia sẻ theo hình thức hoàn toàn hoặc không hoàn toàn đều cho thấy các sự kiện thay đổi chuỗi trình tự DNA mang tính chất trao đổi một cách thường xuyên giữa các alen Pib. Trong một vài alen mới của gen Pib, sự đa dạng của nucleotide tỏ ra khá cao tại domain LRR, trong khi đó, những alen khác được phân bố trong các domains NB-ARC và LRR. Hầu hết các amino acids đa hình trong domains LRR và NB-ARC2 được người ta dự đoán là những thành phần dễ hòa tan. Rất nhiều alen và chỉ thị SNPs độc nhất vô nhị là chuyên biệt theo từng quốc gia, cho thấy một cách chọn lọc mang tính chất đa dạng của những alen tại các vùng địa lý khác nhau, khi đáp ứng với quần thể nấm M. oryzae khá thông dụng tại địa phương ấy. Các alen mới của gen Pib là nguồn vật liệu di truyền rất quan trọng trong chương trình lai tạo giống lúa kháng đạo ôn và cung cấp cho chúng ta thông tin mới về tương tác giữa ký chủ và ký sinh ở mức độ phân tử.

 

Xem: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4917536/

GS. Bùi Chí Bửu lược dịch.

 

Hình: Chọn gen ứng cử viên bằng kỹ thuật “allele mining” gen Pib.

Các mẫu giống lúa thu thập từ 12 quốc gia trồng lúa chủ lực được chọn trên cơ sở kiểu hình kháng (cấp 0) theo UBN và kháng được ít nhất hai trong năm mẫu phân lập nấm đạo ôn (A). Các mẫu giống lúa này phản ứng về mặt phân tử là dương tính đối với Pib trên cơ sở thanh lọc qua Nsb marker để chọn các ứng cử viên, sau đó,  các ứng cử viên mà Pib rất thành công trong khuếch đại PCR đã được biểu hiện. Hình “molecular screening” các mẫu giống lúa để chọn ra các alen của Pib bằng kỹ thuật “allele mining” với những “candidates” trong hình (B). 1 kb, DNA marker; LTH, negative control; Pib, positive control (Pib-monogenic line); WC, water control; 1–11, test accessions. Các mẫu giống lúa dương tính với Pib là 2 (IRGC-4471), 3 (IRGC-4552), 4 (IRGC-4553), 7 (IRGC-4574), 8 (IRGC-4619), 9 (IRGC-4633), 10 (IRGC-4634), và 11 (IRGC-4642).  Băng 629 bp (trên) biểu thị  Pib và băng ∼250 bp (dưới) biểu thị các “actin band”.

Trở lại      In      Số lần xem: 1618

[ Tin tức liên quan ]___________________________________________________
  • Bản đồ di truyền và chỉ thị phân tử trong trường hợp gen kháng phổ rộng bệnh đạo ôn của cây lúa, GEN Pi65(t), thông qua kỹ thuật NGS
  • Bản đồ QTL chống chịu mặn của cây lúa thông qua phân tích quần thể phân ly trồng dồn của các dòng con lai tái tổ hợp bằng 50k SNP CHIP
  • Tuần tin khoa học 479 (16-22/05/2016)
  • Áp dụng huỳnh quang để nghiên cứu diễn biến sự chết tế bào cây lúa khi nó bị nhiễm nấm gây bệnh đạo ôn Magnaporthe oryzae
  • Vai trò của phân hữu cơ chế biến trong việc nâng cao năng năng suất và hiệu quả kinh tế cho một số cây ngắn ngày trên đất xám đông Nam Bộ
  • Tuần tin khoa học 475 (18-24/04/2016)
  • Vi nhân giống cây măng tây (Asparagus officinalis L.)
  • Thiết lập cách cải thiện sản lượng sắn
  • Nghiên cứu xây dựng hệ thống dự báo, cảnh báo hạn hán cho Việt Nam với thời hạn đến 3 tháng
  • Liệu thủ phạm chính gây nóng lên toàn cầu có giúp ích được cho cây trồng?
  • Tuần tin khoa học 478 (09-15/05/2016)
  • Sinh vật đơn bào có khả năng học hỏi
  • Côn trùng có thể tìm ra cây nhiễm virus
  • Bản đồ QTL liên quan đến tính trạng nông học thông qua quần thể magic từ các dòng lúa indica được tuyển chọn
  • Nghiên cứu khẳng định số loài sinh vật trên trái đất nhiều hơn số sao trong giải ngân hà chúng ta
  • Cơ chế di truyền và hóa sinh về tính kháng rầy nâu của cây lúa
  • Vật liệu bọc thực phẩm ăn được, bảo quản trái cây tươi hơn 7 ngày mà không cần tủ lạnh
  • Giống đậu nành chống chịu mặn có GEN gmst1 làm giảm sự sinh ra ROS, tăng cường độ nhạy với ABA, và chống chịu STRESS phi sinh học của cây Arabidopsis thaliana
  • Khám phá hệ giác quan cảm nhận độ ẩm không khí ở côn trùng
  • Phương pháp bền vững để phát triển cây lương thực nhờ các hạt nano
Designed & Powered by WEBSO CO.,LTD