Phân tích genome ty thể bộ của lúa hoang Oryza minuta & so sánh với các loài khác có liên quan
Thứ ba, 19-04-2016 | 08:14:11
|
Nguồn: Asaf S, Khan AL, Khan AR, Waqas M, Kang SM, Khan MA, Shahzad R, Seo CW, Shin JH, Lee IJ. 2016. Mitochondrial Genome Analysis of Wild Rice (Oryza minuta) and Its Comparison with Other Related Species. PLoS One. 2016 Apr 5;11(4):e0152937. doi: 10.1371/journal.pone.0152937. eCollection 2016. TÓM TẮTOryza minuta (họ Poaceae) là loài lúa hoang có nhiễm sắc thể thuộc tứ bội (4n) có quan hệ gần với lúa trồng, nguồn gốc địa lý thuộc quần đảo Philippines, thuộc genome BBCC. O. minuta cò khả năng kháng rất nhiều đối tượng gây hại cho cây lúa ví dụ như bệnh bạc lá (BB), rầy lưng trắng (WBPH) và rầy nâu (BPH). Ở đây, các tác giả đã giải trình tự và ghi chú trên ký tự của toàn bộ genome ty thể bộ của loài O. minuta. Bộ genome mtDNA có kích thước 515.022 bp, chứa 60 gen mã hóa protein, 31 tRNA gen và hai rRNA gen. Bộ genome ty thể bộ (mitochondrial genome) có cách thức sắp xếp các gen trên cơ sở nucleotide rất giống với những gì đã có trong họ Poaceae (89%) so với lúa hoang O. rufipogon. So sánh với với các loài có quan hệ huyết thống; hấu hết các gen như vậy đều có những chức năng đã được biết, chúng được bảo tồn trong các thành phần thuộc họ Poaceae. Tương tự, bộ genome ty thể bộ của O. minuta chia sẻ được 24 gen mã hóa protein, 15 tRNA gen and 1 ribosomal RNA gen với các loài lúa khác (indica và japonica). Mối quan hệ di truyền tiến hóa và di truyền huyết thống được người ta phân tích cho thấy: O. minuta quan hệ rất gần gủi hơn với lúa hoang O. rufipogon so với các loài lúa hoang khác. Nghiên cứu như vậy vô cùng cần thiết cung cấp kiến thức về sự đa dạng trong tiến hóa giữa các loài và phân tích các ngân hàng gen phổ biến phục vụ cho chiến lược cải tiến giống lúa thích nghi với các kịch bản về biến đổi khí hậu đang diễn ra.
Xem http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27045847
GS Bùi Chí Bửu lược dịch
Figure: Fig 1. Bản đồ hệ gen ty thể của O. minuta. Các tính năng trên chiều kim đồng hồ - và sợi ngược chép được rút ra ở bên trong và bên ngoài của vòng tròn, tương ứng. |
Trở lại In Số lần xem: 1568 |
[ Tin tức liên quan ]___________________________________________________
|