Chào mừng Quý độc giả đến với trang thông tin điện tử của Viện Khoa học Kỹ thuật Nông nghiệp miền Nam

Tin nổi bật
Thành tích

Huân chương Ðộc lập

- Hạng 1 - Hạng 2 - Hạng 3

Huân chương Lao động

- Hạng 1 - Hạng 2 - Hạng 3

Giải thưởng Nhà nước

- Nghiên cứu dinh dưởng và thức ăn gia súc (2005)

- Nghiên cứu chọn tạo và phát triển giống lúa mới cho xuất khẩu và tiêu dùng nội địa (2005)

Giải thưởng VIFOTEC

- Giống ngô lai đơn V2002 (2003)

- Kỹ thuật ghép cà chua chống bệnh héo rũ vi khuẩn (2005)

- Giống Sắn KM 140 (2010)

Trung tâm
Liên kết website
lịch việt
Thư viện ảnh
Video
Trung Tâm NC Khoai tây, Rau và Hoa, trồng rau Hàn Quốc theo VietGap

Thống kê truy cập
 Đang trực tuyến :  5
 Số lượt truy cập :  28473838
Phân tích phiên mã độ dài đầy đủ của cùng bộ gen đậu tương với các phản ứng tương thích và không tương thích với heterodera glycines cho thấy lây nhiễm tuyến trùng kích hoạt phản ứng bảo vệ của thực vật
Thứ bảy, 25-06-2022 | 05:32:50

Minghui Huang(1), Ye Jiang(1,2), Ruifeng Qin(1,2), Dan Jiang(1,2), Doudou Chang(1,2), Zhongyan Tian(2), Chunjie Li(1) và Congli Wang(1)

Võ Như Cầm biên dịch

TÓM TẮT

Giải trình tự phiên mã có độ dài đầy đủ với các bài đọc dài là một công cụ mạnh mẽ để phân tích các sự kiện phiên mã và sau phiên mã; tuy nhiên, nó đã không được áp dụng trên đậu tương (Glycine max). Ở đây, một phân tích phiên mã tương đối có chiều dài đầy đủ được thực hiện trên kiểu gen đậu tương 09-138 bị nhiễm tuyến trùng nang đậu tương (SCN, Heterodera glycines) chủng 4 (SCN4, phản ứng không tương thích) và chủng 5 (SCN5, phản ứng tương thích) bằng cách sử dụng Công nghệ Oxford Nanopore. Mỗi mẫu trong số 9 mẫu có chiều dài đầy đủ được thu thập 8 ngày sau khi cấy có/không có tuyến trùng tạo ra trung bình 6,1Gb dữ liệu sạch và tổng số 65.038 trình tự phiên mã. Sau khi loại bỏ các bản sao thừa, 1.117 gen mới và 41.096 bản sao mới đã được xác định. Bằng cách phân tích cấu trúc trình tự của các bản sao mới lạ, có tổng cộng 28.759 trình tự khung đọc mở (ORF) hoàn chỉnh, 5.337 yếu tố phiên mã, 288 RNA dài không mã hóa và 40.090 phiên mã mới với chú thích chức năng đã được dự đoán. Gene Ontology (GO) và Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) phân tích làm giàu các gen biểu hiện khác biệt (DEG) cho thấy rằng hormone tăng trưởng, con đường tín hiệu được kích hoạt bởi auxin và tăng trưởng tế bào đa chiều, và con đường sinh tổng hợp phenylpropanoid được làm giàu bằng cách nhiễm cả hai chủng tuyến trùng. Nhiều DEG liên quan đến các yếu tố phản ứng với căng thẳng, con đường dẫn truyền tín hiệu hormone-thực vật và con đường tương tác giữa thực vật - mầm bệnh với nhiều điều chỉnh hơn được phát hiện trong phản ứng không tương thích với lây nhiễm SCN4 và phát hiện nhiều DEG có điều chỉnh liên quan đến quá trình biến đổi thành tế bào và xử lý sinh học carbohydrate trong phản ứng tương thích với lây nhiễm SCN5 khi so sánh với nhau. Trong số đó, các DEG chồng chéo với sự khác biệt về số lượng đã được kích hoạt. Sự kết hợp tương tác giữa protein-protein với DEGs lần đầu tiên chỉ ra rằng nhiễm tuyến trùng đã kích hoạt tương tác giữa yếu tố phiên mã WRKY và VQ (valine-glutamine motif) để góp phần bảo vệ đậu tương. Kiến thức về cơ chế tương tác SCN-đậu tương làm mô hình sẽ giúp hiểu rõ hơn về các tương tác khác giữa thực vật và tuyến trùng.

 

Từ khóa: giải trình tự phiên mã chiều dài đầy đủ, glycine max, Heterodera glycines, phản ứng tương thích và không tương thích, tương tác VQ – WRKY

 

Chi tiết xin xem tệp đính kèm!


1Phòng thí nghiệm Key về chọn giống thiết kế phân tử đậu tương, Viện Địa lý và Nông học Đông Bắc, Học viện Khoa học Trung Quốc, Cáp Nhĩ Tân, Trung Quốc

2Học viện Khoa học Nông nghiệp Hắc Long Giang, Đại Khánh, Trung Quốc

Trở lại      Tải file      In      Số lần xem: 33

[ Tin tức liên quan ]___________________________________________________
  • Bản đồ di truyền và chỉ thị phân tử trong trường hợp gen kháng phổ rộng bệnh đạo ôn của cậy lúa, GEN Pi65(t), thông qua kỹ thuật NGS
  • Bản đồ QTL chống chịu mặn của cây lúa thông qua phân tích quần thể phân ly trồng dồn của các dòng con lai tái tổ hợp bằng 50k SNP CHIP
  • Tuần tin khoa học 479 (16-22/05/2016)
  • Áp dụng huỳnh quang để nghiên cứu diễn biến sự chết tế bào cây lúa khi nó bị nhiễm nấm gây bệnh đạo ôn Magnaporthe oryzae
  • Vai trò của phân hữu cơ chế biến trong việc nâng cao năng năng suất và hiệu quả kinh tế cho một số cây ngắn ngày trên đất xám đông Nam Bộ
  • Tuần tin khoa học 475 (18-24/04/2016)
  • Vi nhân giống cây măng tây (Asparagus officinalis L.)
  • Thiết lập cách cải thiện sản lượng sắn
  • Nghiên cứu xây dựng hệ thống dự báo, cảnh báo hạn hán cho Việt Nam với thời hạn đến 3 tháng
  • Liệu thủ phạm chính gây nóng lên toàn cầu có giúp ích được cho cây trồng?
  • Tuần tin khoa học 478 (09-15/05/2016)
  • Sinh vật đơn bào có khả năng học hỏi
  • Côn trùng có thể tìm ra cây nhiễm virus
  • Bản đồ QTL liên quan đến tính trạng nông học thông qua quần thể magic từ các dòng lúa indica được tuyển chọn
  • Nghiên cứu khẳng định số loài sinh vật trên trái đất nhiều hơn số sao trong giải ngân hà chúng ta
  • Cơ chế di truyền và hóa sinh về tính kháng rầy nâu của cây lúa
  • Vật liệu bọc thực phẩm ăn được, bảo quản trái cây tươi hơn 7 ngày mà không cần tủ lạnh
  • Giống đậu nành chống chịu mặn có GEN gmst1 làm giảm sự sinh ra ROS, tăng cường độ nhạy với ABA, và chống chịu STRESS phi sinh học của cây Arabidopsis thaliana
  • Khám phá hệ giác quan cảm nhận độ ẩm không khí ở côn trùng
  • Phương pháp bền vững để phát triển cây lương thực nhờ các hạt nano
Designed & Powered by WEBSO CO.,LTD