|
 Đang trực tuyến :
15 |
|
 Số lượt truy cập :
33259752 |
|
|
|
|
| Định tính toàn bộ genome và phân tích họ gen “yếu tố phiên mã” bzip liên quan đến tính chống chịu stress của cây sắn |
|
Họ yếu tố phiên mã bZIP (basic leucine zipper) có vai trò quan trọng trong nhiều lĩnh vực của các tiến trình sinh học. Hiện nay, người ta chưa có thông tin gì về họ bZIP trong loài cây trồng vùng nhiệt đới như cây sắn. Ở đây, người ta đã phân lập được 77 bZIP genes của cây sắn. Kết quả phân tích di truyền tiến hóa cho thấy MebZIPs có thể được chia thành 10 họ phụ (subfamilies), trên cơ sở motif được bảo tồn ra làm sao và cấu trúc của gen như thế nào. Phân tích mức độ biểu hiện tổng quát cho thấy MebZIPs có những thành phần thể hiện giống |
|
Nguồn: Hu W, Yang H, Yan Y, Wei Y, Tie W, Ding Z, Zuo J, Peng M, Li K. 2016. Genome-wide characterization and analysis of bZIP transcription factor gene family related to abiotic stress in cassava. Sci Rep. 2016 Mar 7;6:22783. doi: 10.1038/srep22783. Tóm tắtHọ yếu tố phiên mã bZIP (basic leucine zipper) có vai trò quan trọng trong nhiều lĩnh vực của các tiến trình sinh học. Hiện nay, người ta chưa có thông tin gì về họ bZIP trong loài cây trồng vùng nhiệt đới như cây sắn. Ở đây, người ta đã phân lập được 77 bZIP genes của cây sắn. Kết quả phân tích di truyền tiến hóa cho thấy MebZIPs có thể được chia thành 10 họ phụ (subfamilies), trên cơ sở motif được bảo tồn ra làm sao và cấu trúc của gen như thế nào. Phân tích mức độ biểu hiện tổng quát cho thấy MebZIPs có những thành phần thể hiện giống hoặc nhau tùy theo các mô khác nhau giữa những giống sắn canh tác và các loài phụ hoang dã. Phân tích transcriptome của ba giống sắn trong nghiên cứu này cho thấy rất nhiều gen MebZIPs đã bị kích hoạt bởi khô hạn trong rễ của loài phụ W14, điều này nói lên rằng các gen ấy giúp cây sắn chống chịu khô hạn rất tốt. Phân tích mức độ thể hiện của gen với các gen MebZIPs được chọn đã phản ứng với stress do áp suất thẩm thấu, mặn, lạnh, ABA và H2O2. Như vậy, các gen này có thể tham gia tích cực vào các chu trình truyền tín hiệu. Các tác giả đã phân tích một cách hệ thống điều tiết sự phiên mã của gen MebZIPs. Họ quan sát được cấu trúc, mô chuyên biệt và những ứng cử viên phản ứng được với stress của những gen như vậy để tìm ra đặc điểm của chúng trong giới thực vật, các cách thức điều tiết sự phiên mã của MebZIP, và đặt nền tảng cho nguyên tắc phản ứng với stress phi sinh học của bZIP.
GS Bùi Chí Bửu lược dịch Xem: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26947924
Hình 1: Phân tích tiến hóa của các bZIP proteins của sắn, Arabidopsis, và lúa. Người ta đã sử dụng 77 bZIPs của sắn, 72 bZIPs của Arabidopsis và 89 bZIPs của lúa để tạo ra cây gia hệ NJ với 1000 bootstrap. Những bZIP proteins được xếp nhóm có 10 nhóm phụ (A, B, C, D, E, F, G, H, I, và S). |
Trở lại
In
Số lần xem: 4799
|
|
[ Tin tức liên quan ]___________________________________________________
|
(15).png "Định tính toàn bộ genome và phân tích họ gen “yếu tố phiên mã” bzip liên quan đến tính chống chịu stress của cây sắn")
