Một số kết quả nghiên cứu xác định các QTLS và gen mới liên quan đến sự phát triển bộ rễ trong một tập đoàn giống lúa Việt Nam

Đỗ Năng Vịnh(1), Hà Thị Thúy(1), Phùng Thị Phương Nhung(1), Mai Đức Chung(1), Hoàng Thị Giang(1), Nguyễn Thị Huế(1), Nguyễn Thị Thơm(1), Nguyễn Diệu Thu(1), Nguyễn Lê Khanh(1), Đinh Văn Lâm(1) , Trương Thị Minh Huệ(1), Brigitte Courtois(3) và Pascal Gantet(2).

1Viện Di truyền Nông nghiệp
2Viện Nghiên cứu vì sự phát triển IRD - Pháp
3 Trung tâm Nghiên cứu Nông nghiệp vì sự phát triển CIRAD- Pháp

TÓM TẮT

Nhóm nghiên cứu đã sử dụng phương pháp GWAS (Genome-wide association study) đối với các tính trạng phát sinh bộ rễ lúa trong tập đoàn 182 giống lúa bản địa Việt Nam. Với tổng số 50 000 chỉ thị GBS đã được sử dụng, thu được tổng số 25 971 marker cho chỉ số đa hình (PIC) biến động từ 1% đến 50%. Kết quả thống kê di truyền liên kết đối với các tính trạng phát sinh bộ rễ, xác định được 66 markers cho toàn bộ tập đoàn nghiên cứu có sự sai khác ý nghĩa ở mức P-value ≤ 1E-04, tương đương với số QTLs đã được xác định. Các marker liên kết với các tính trạng ở mức ý nghĩa cao nhất được ghi nhận là: với độ sâu của rễ (DEPTH) trên nhiễm sắc thể số 1(q17; P=2,67e-07) và marker liên kết với số lượng rễ chính (NCR) trên nhiễm sắc thể 11 (q45; P=6,59e-07) trong toàn bộ tập đoàn nghiên cứu.

Từ khóa: phương pháp GWAS, rễ lúa, DArT markers, QTLs

Chi tiết xin xem tệp đính kèm!

Trích Kỷ yếu Hội Thảo Quốc gia về Khoa học cây trồng lần thứ hai.