Nghiên cứu liên kết trên toàn hệ gen hàm lượng silic trong thân của cây lúa

Dương Xuân Tú(1), Nguyễn Văn Tuất(2), Nguyễn Thị Hường(1), Lê Thị Thanh(1), Nguyễn Thị Thu(1), Phạm Thiên Thành(1), Nguyễn Thế Dương(1), Nguyễn Văn Khởi(1), Đào Trọng Nhân(1), Nguyễn Thanh Tuấn(3), Simon McQueen Mason(4), Leonardo D. Gomez(4), Andrea Harper(4), Caragh Whitehead(4), Claire Halpin(5), Robbie Waugh(5)

TÓM TẮT

Trong nghiên cứu này, GWAS về hàm lượng silic trong thân của cây lúa dựa trên cơ sở dữa liệu kiểu gen (genotyping by sequencing - GBS) và hàm lượng silic trong thân của 170 mẫu giống lúa được tiến hành khảo sát. Kết quả GWAS đã xác định được 9 SNP nằm trên NST số 1, số 6 và số 11 với tần số alen từ 18% đến 48% có ý nghĩa tạo nên sự khác nhau về hàm lượng silic trong thân của các giống lúa. 9 gen đã được dự kiến cho hàm lượng silic trong thân của cây lúa ở các vị trí SNP tương ứng. Kết quả nghiên cứu này là cơ sở cho các nghiên cứu tiếp theo để phát triển chỉ thị phân tử trong chọn tạo giống lúa có hàm lượng silic trong rơm rạ phù hợp

Từ khóa: Lúa, nghiên cứu trên hệ gen, Silic, SNP

Chi tiết xin xem tệp đính kèm!

1. Viện Cây lương thực và Cây thực phẩm;

2. Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam

3. Học Viện Nông nghiệp Việt Nam;

4. Đại học York, Vương quốc Anh;

5. Đại học Dundee, Vương quốc Anh

Trích TC KHCN NN Việt Nam