Nghiên cứu nhóm gen quy định protein vận chuyển đường sucrose ở cây diêm mạch (Chenopodium quinoa) bằng công cụ tin sinh học dữ liệu lớn

Phạm Phương Thu(1), Trần Thị Phương Liên(1), Tạ Hồng Lĩnh(2), Chu Đức Hà(3*), Nguyễn Thị Ngọc Ánh(4), Bùi Thị Thu Hương(4), Nguyễn Văn Lộc(4), Lê Thị Ngọc Quỳnh(5), Nguyễn Sông Thao(6), Trần Thị Thanh Huyền(6)

TÓM TẮT

Diêm mạch (Chenopodium quinoa) là một trong những đối tượng cây trồng có giá trị kinh tế cao và được trồng trọt phổ biến trên thế giới. Tuy nhiên, những hiểu biết về cơ chế thích nghi của cây diêm mạch vẫn còn hạn chế do thông tin di truyền của loài mới chỉ được ghi nhận gần đây. Trong nghiên cứu này, họ protein vận chuyển đường sucrose, SWEET (Sugar Will Eventually be Exported Transporter), đã được tìm hiểu ở cây diêm mạch thông qua các công cụ phân tích tin sinh học dữ liệu lớn. Kết quả đã xác định được 29 gen CqSWEET trong hệ gen của diêm mạch. Trong đó, phần lớn họ gen CqSWEET đều chứa năm hoặc sáu exon, tương tự như họ SWEET ở các loài thực vật khác. Đánh giá dữ liệu biểu hiện cho thấy các gen CqSWEET có biểu hiện đa dạng tại bộ phận chính trong cây. Đáng chú ý, CqSWEET09 và 20 có biểu hiện đặc thù tại hoa và quả. Kết quả của nghiên cứu này đã cung cấp những dẫn liệu khoa học cho việc tìm hiểu về vai trò của họ CqSWEET liên quan đến tính chống chịu bất lợi ở cây diêm mạch.

Từ khóa: Cây diêm mạch (Chenopodium quinoa), dữ liệu lớn, SWEET, tin sinh học

Chi tiết xin xem tệp đính kèm!

1 Đại học Sư phạm Hà Nội 2;

2 Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam

3 Đại học Công nghệ, Đại học Quốc gia Hà Nội;

4 Học viện Nông nghiệp Việt Nam;

⁵ Đại học Thủy lợi;

⁶ Đại học Sư phạm Hà Nội

* Tác giả chính