Reyazul Rouf Mir, Himabindu Kudapa, Sandhya Srikanth, Rachit K. Saxena, Ashutosh Sharma, Sarwar Azam, Kulbhushan Saxena, R. Varma Penmetsa, Rajeev K. Varshney

Nguồn: THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, December 2014, Volume 127, Issue 12, pp 2663-2678

http://link.springer.com/article/10.1007/s00122-014-2406-8

TÓM TẮT

Thông tin chính

Một gen ứng cử viên, CcTFL1, đối với tính trạng “determinacy” trong cây đậu triều (pigeonpea) thông qua phân tích chuỗi trình tự, bản đồ, phân tích QTL kết hợp với phương pháp genome so sánh và phổ thể hiện gen (profiling).

Tóm tắt

Cây đậu triều với tên tiếng Anh là Pigeonpea (Cajanus cajan): là cây họ đậu quan trọng đứng hàng thứ sáu trên thế giới với diện tích canh tác ước đạt 5 triệu Ha. Determinacy là một tính trạng nông học quan trọng (lập trình cách thức trổ bông của cây đậu) được chọn lọc trong quá trình con người thuần hóa giống đậu này. Trong nghiên cứu, bảy genes có liên quan đến tính trạng “determinacy”/thành phần hoa đậu của cây pigeonpea đã được xác định thông qua cách tiếp cận với ngành “comparative genomics” (genome học có tính chất so sánh. Phân tích chỉ thị phân tử SNP những gen ứng cử viên ấy (candidate genes) trên 142 dòng cây đậu triều, người ta phát hiện ra có một mối liên quan rất mạnh mẽ của những SNPs với tính trạng “determinacy” đối với 3 gen trong 7 gen nêu trên. Tiếp theo đó, người ta phân tích QTL biểu thị trước mắt có một gen, CcTFL1, đóng vai trò như một gen ứng cử viên đối với tính trạng “determinacy” của cây đậu triều. Bởi vì nó giải thích được 45–96 % biến thiên kiểu hình của tính trạng determinacy, giải thích được biến thiên kiểu hình của thời gian trổ bông là 45 % và chiều cao cây là 77 %. Phân tích genome học có tính chất so sánh CcTFL1 của genome cây đậu nành (Glycine max) và đậu Hà Lan (Phaseolus vulgaris) ớ mức độ “micro-syntenic” cho chúng tôi một sự tin cậy mạnh mẽ hơn CcTFL1 là gen ứng cử viên. Những phát hiện như vậy được minh chứng bởi phân tích sự biểu hiện với cách thức điều tiết theo kiểu DOWN của gen CcTFL1 trong một dòng determinate khi so sánh với một dòng trái ngược lại “indeterminate line”. Những chỉ thị phân tử dựa trên gen đã được phát triển trong nghiên cứu này sẽ cho phép chúng ta thao tác nhanh chóng hơn tính trạng “determinacy” phục vụ chương trình lai tạo giống trong tương lai cây pigeonpea và cũng sẽ giúp cho chúng ta phát triển những chỉ thị phân tử của những tính trạng như vậy trong các loài cây họ đậu có quan hệ gần.

Bùi Chí Bửu lược dịch.