Các nhà khoa học thuộc Viện Di truyền Nông nghiệp và Đại học Phương Đông đã tiến hành phân lập, giải và phân tích trình tự phân đoạn S9 của 13 chủng SRBSDV (Southern rice black-streaked dwarf virus) đại diện cho một số vùng sinh thái trồng lúa từ miền trung trở ra nhằm nghiên cứu đa dạng di truyền, mức độ tiến hóa và tiến tới nghiên cứu vai trò của protein P9-1 trên phân đoạn S9 của virut.

Để nghiên cứu chức năng hệ gien và mức độ tiến hóa, 13 phân đoạn S9 của virut lua lùn sọc đen phương Nam – SRBSDV từ những vùng sinh thái trồng lúa ở miền Bắc và Trung Việt Nam đã được phân lập và giải trình tự. So sánh trình tự nucleotit của 13 phân đoạn  S9 của các chủng SRBSDV Việt Nam cho kết quả tương đồng nucleotit 98,5 – 99,6%.  So sánh trình tự nucleotit  của các phân đoạn S9 của các chủng SRBSDV của Việt Nam với 7 phân đoạn S9 của các chủng SRBSDV Trung Quốc cho thấy có độ đồng nhất rất cao (>98%). Sử dụng phần mềm MEGA5.2 xây dựng cây phả hệ nhằm đánh giá đa dạng di truyền và nguồn gốc phát sinh giữa các phân đoạn S9 của Việt Nam với nhau và với các chủng của Trung Quốc cho thấy sự xuất hiện xen kẽ giữa các chủng SRBSDV của Việt Nam và Trung Quốc trên toàn cây và sự gần gũi của các chủng virut thuộc các tỉnh cách xa nhau trên cây phả hệ chứng tỏ chúng cùng xuất phát từ một quần thể virut duy nhất, sự phát tán của chúng qua các vùng sinh thái khác nhau là do sự di cư của vector truyền bệnh – rầy lưng trắng. Tuy nhiên, phần lớn các phân đoạn S9 của Việt Nam có xu hướng tập trung vào một nhóm trên cây phả hệ, điều này phản ánh mức độ tiến hóa nhanh của các chủng SRBSDV ở Việt Nam, tiến tới hình thành nên một chủng virut mới trong tương lai. Phân tích cấu trúc bậc 2 của protein P9.1 với virut lùn sọc đen (Rice black-streaked dwarf virus - RBSDV) cho thấy sự tương đồng cao, có thể chứng tỏ chức năng của P9.1 trong hình thành hạt virut SRBSDV.

ntbtra - canthostnews, theo Tạp chí NN & PTNT.