Cải thiện di truyền của quần thể heo bản địa tại các nước đang phát triển vùng nhiệt đới có thể đóng góp thiết thực trong việc bảo tồn và sử dụng hiệu quả nguồn gene địa phương.  Để có thể xây dựng được một chương trình nhân giống heo hiệu quả đòi hỏi  cần có kiến thức về các thông số di truyền của các tính trạng kinh tế quan trọng của đàn heo. Sự phân tích biến đổi của các thông số di truyền này đã được thực hiện dưới các điều kiện của vùng nhiệt đới và đã được công bố từ nắm 1974 đến 2009, điều này nhằm cung cấp liên tục sự ước lượng của các thông số di truyền. Các số liệu thu thập được phân tích bằng phần mềm BLUP, vẫn chưa được phổ biến tại các nước đang phát triển. Chương trình chọn giống dựa trên bộ gene (genome) đã cung cấp một cách tiếp cận mới, giúp đạt được tiến bộ di truyền nhanh hơn, nhất là trong trường hợp chưa có một chương trình quản lý giống để thu thập đầy đủ các số liệu gia phả. 

Để làm đều này, Akanno (2012) đã sử dụng micro-array với biochip có khoảng 60.000 marker SNP. Sự liên kết không cân bằng (LD) trong quần thể heo nhiệt đới với các mức quan sát khác nhau đã được tái tạo và sử dụng. Sử dụng phân tích hồi quy dãy để dự đoán về di truyền.

Kết quả của tác giả cho thấy: độ chính xác mong muốn của giá trị giống di truyền (GBV) biến động từ 0,31-0,86 dựa trên bộ số liệu hợp lệ. Chọn giống mở rộng trên bộ gene (GWS) đã giúp tăng độ chính xác của GBV lên cao hơn so với phương pháp BLUP truyền thống, đặc biệt là đối với các tính trạng có hệ số di truyền thấp hay những gia súc hậu bị chưa có các số liệu về khả năng sản xuất. Thực hiện trên quần thể lai có độ chính xác cao hơn trên quần thể thuần. GWS tốt hơn các phương pháp truyền thống vì tăng nhanh tiến bộ di truyền, duy trì sự biến đổi di truyền trong khi mức độ lai gần thấp, đặc biệt là đối với các tính trạng có hệ số di truyền thấp, bằng cách khai thác hiệu quả LD và ảnh hưởng của trung bình quần thể.

Chiến lược chọn giống này bao gồm hai bước như sau (1) sử dụng GWS trên đàn hậu bị tại các trung tâm kiểm tra năng suất nhằm chọn ra những ứng cử viên để thay đàn trong đàn giống hạt nhân và (2) đánh giá, so sánh những con heo giống được chọn lọc bằng GWS với những con heo giống được chọn lọc bằng các phương pháp truyền thống  đang áp dụng. So với các phương pháp truyền thống khác, GWS đã gia tăng (tiến bộ di truyền) khoảng 38-172% hằng năm khi thực hiện trên quần thể có LD trung bình, và tăng khoảng 2-50% khi thực hiện trên quần thể có LD thấp.

Lược dịch: TS. Chung Anh Dũng.

Nguồn: Genome-Wide Selection Program for Improvement of Indigenous Pigs in Tropical Developing Countries - by Everestus Chima Akanno.