Biểu hiện gen anthocyanin đã được nghiên cứu rộng rãi trong lá, quả và hoa của nhiều loại thực vật, sự tích lũy anthocyanin trong gốc rễ của cà rốt hoặc các loài khác.

Chúng tôi xác định số lượng biểu hiện của sáu gen sinh tổng hợp anthocyanin [phenylalanine ammonia-lyase (PAL3), chalcone synthase (CHS1), flavanone 3-hydroxylase (F3H), dihydroflavonol 4-reductase (DFR1), leucoanthocyanidin dioxygenase (LDOX2), và UDP-glucose: flavonoid 3-O-glucosyltransferase (UFGT) trong ba loại cà rốt lai với màu sắc tương phản với loại gốc: cứng màu tím (vỏ cây và chất gỗ); tím bên ngoài vỏ cây / chất gỗ màu cam và vỏ cây cam và chất gỗ. Năm  gen (CHS1, DFR1, F3H, LDOX2, PAL3) tích lũy ở mức độ cao trong cà rốt màu tím đậm, ít hơn trong cà rốt màu tím-màu cam, và thấp hoặc không có bảng điểm trong cà rốt màu cam.

Biểu hiện gen trùng hợp với sự tích lũy anthocyanin. Ngược lại, UFGT biểu hiện được so sánh trong cà rốt màu tím và màu cam và tương đối không thay đổi trong quá trình phát triển rễ. Ngoài ra, năm gen sinh tổng hợp anthocyanin [FLS1 (synthase flavonol), F3H, LDOX2, PAL3, và UFGT] và ba yếu tố phiên mã anthocyanin (DcEFR1, DcMYB3 và DcMYB5) được lập bản đồ trong một dân số ly cho P 1 locus điều kiện gốc màu tím màu. P 1 ánh xạ tới nhiễm sắc thể 3 và trong tám gen sinh tổng hợp anthocyanin, chỉ F3H và FLS1 có liên quan đến P 1. Các biểu hiện gen và dữ liệu bản đồ cho thấy một quy định kiểm soát phối hợp anthocyanin biểu trong cà rốt gốc và thiết lập một khuôn khổ cho việc nghiên cứu con đường anthocyanin trong cà rốt, và họ cũng cho rằng không gen nào trong số các gen được đánh giá là một ứng cử viên cho P 1.