Nguồn: A.D. Chowdhury, G. Haritha, T. Sunitha, S.L. Krishnamurthy, B. Divya, G. Padmavathi, T. Ram, N. Sarla. 2016. Haplotyping of Rice Genotypes Using Simple Sequence Repeat Markers Associated with Salt Tolerance. RICE SCIENCE J., 16 November 2016

Stress mặn là vấn đề nghiêm trọng đối với hầu hết các vùng sản xuất lúa trên toàn thế giới. Một QTL Saltol chủ lực kết hợp với tính chống chịu mặn ở giai đoạn mạ đã được lập bản đồ trên nhiễm sắc thể số 1. Nghiên cứu này nhằm mục đích định tính đa dạng của “haplotype” tại vùng Saltol và những QTLs bổ sung liên kết với tính chống chịu mặn. Chống chịu mặn ở giai đoạn mạ được đánh giá trên 54 giống lúa với thang điểm chống chịu từ 1 đến 9, trong điều kiện mặn EC = 10 dSm^-1. Bảy dòng lúa mới bao gồm 3 dòng có xuất xứ từ cặp lai giữa KMR3/O. rufipogon (du nhập gen mục tiêu từ lua hoang) cho thể khả năng chịu năng tương đương với giống lúa FL478. Chúng được xem như là nguồn vật liệu tốt cung cấp gen /alen điều khiển tính chống chịu mặn. Chỉ thị phân tử SSR (simple sequence repeat) RM289 minh chứng chỉ có hai alen và RM8094 minh chứng bảy alen. Giá trị PIC (polymorphism information content) biến thiên từ 0.55 đối với RM289 đến 0.99 đối với RM8094 và RM493. Trên cơ sở 14 SSR markers, có 54 dòng lúa được phân ra thành hai clusters di truyền. Mười bốn haplotypes được xác định trên cơ sở những marker liên kết với gen Saltol như FL478 làm dữ liệu tham chiếu. Các alen của RM8094 và RM3412 có thể phân biệt giống chống chịu mặn với giống nhiễm mặn khá rõ. Do vậy, chúng có thể rất hữu ích phục vụ chiến lược chọn giống nhờ chỉ thị phân tử ở giai đoạn mạ. Chỉ thị RM10720 trên NST 1 và RM149, RM264 trên NST 8 có thể giúp chúng ta thấy rõ giống kháng khác biệt với giống nhiễm.

Xem: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1672630816300658

Hình 1: Hình chụp trên gel cho thấy sự khuếch đại các băng tại locus RM8094 trong 54 giống lúa khảo nghiệm.

GS BÙI CHÍ BỬU lược dịch