Hai tiền chất khác nhau của độc tố

Những protein tinh thể của vi khuẩn sống trong đất Bacillus thuringiensis là những độc tố diệt côn trùng thông qua việc hình thành các vi khổng (insecticidal pore forming toxins). Isabel Gómez ctv. thuộc Universidad Nacional Autonoma de Mexico, đã báo cáo rằng có hai dạng “pre-pore” có chức năng khác nhau của Cry1Ab được hình thành, không phải sau khi kết gắn của protoxin hoặc độc tố kích hoạt men protease đối với phân tử nhận “cadherin-receptor”, mà nó được hình thành trước khi cài vào màng. Cả hai dạng “pre-pores” này vô cùng năng động gây ra việc hình thành các tế khổng (pore), mặc dù tính chất của chúng khác nhau, và góp phần vào việc tạo ra chức năng diệt côn trùng. Hơn nữa, các nhà nghiên cứu này đã phân tích oligomer hóa (oligomerization) thể đột biến của protein Cry1AbMod. Đột biến này xóa sạch các quần thể côn trùng khác nhau có tính kháng với Cry toxins, nhưng mất tính hữu hiệu đối với côn trùng nhiễm độc tố. Họ đã tìm thấy rằng Cry1AbMod-protoxin làm giảm đáng kể “oligomerization”, mà không làm giảm Cry1AbMod-toxin, điều ấy giải thích được sự mất khả năng của Cry1AbMod đối với côn trùng nhiễm. Kết quả như vậy đã khẳng định một phương pháp kiểm soát trong tương lai những côn trùng kháng được những Cry proteins. Họ đề nghị rằng không những những côn trùng chủ đích khác nhau có những receptors khác nhau, mà còn khác thể proteases trong ruột. Chính cái ấy sẽ tạo ra ảnh hưởng đến mật độ protoxin/hoạt tính chung của độc tố.

Xem http://www.biochemj.org/bj/imps/abs/BJ20131408.htm.

Cải tiến giống thuốc lá chống chịu được rầy mềm (Peach Potato Aphid) thông qua phân tử RNAi

Kỹ thuật tạo ra phân tử RNA can thiệp (Plant-mediated RNA interference: RNAi) được các nhà khoa học sử dụng để khóa chức năng của gen nào đó bằng chuỗi trình tự ngắn của RNA ứng với một gen đích từ đó làm ngăn cản sự sản sinh ra protein. Kỹ thuật này đã và đang được sử dụng để chống lại sự tấn công của sâu hại cây trồng. Các nhà khoa học của Viện Hàn Lâm Khoa Học Nông Nghiệp Trung Quốc (CAAS) Jianjun Mao và Fanrong Zeng đã nghiên cứu ảnh hưởng của phân tử RNAi kiểm soát được sự gây hại của rầy mềm (peach potato aphid: Myzus persicae), một loài côn trùng có nhiều ký chủ tại nhiều vùng nông nghiệp của thế giới. Họ tiến hành dòng hóa “gap gene hunchback (hb)”. Gen này rất cần thiết cho côn trùng. Vec tơ RNAi của cây được thiết kế và người ta tạo ra được giống thuốc lá transgenic thể hiện tốt Mphb của  dhRNA. Giống thuốc lá này biểu hiện một đoạn hợp nhất khác nhau của transgene. Xét nghiệm sinh học cho thấy thông qua nó khá hiệu quả trên những con rầy mềm mới nở ký sinh trên cây transgenic đồng hợp tử ở thế hệ T2. Nếu cho ăn liên tục trên cây thuốc lá đồng hợp tử ấy, có sự suy giảm hàm lượng Mphb mRNA trong con rầy mềm và sự sinh sản của rầy mềm cũng giảm đi đáng kể. Kết quả chứng minh kỹ thuật làm im lặng gen đích trong cơ thể rầy mềm bằng phân tử can thiệp của cây thuốc lá là khả thi.

Xem tóm tắt http://link.springer.com/article/10.1007/s11248-013-9739-y.

Giải mã trình tự bộ gen “Locusta migratoria” (châu chấu)

Các nhà khoa học thuộc BGI (Beijing Genome Institute), Viện Hàn Lâm Khoa Học Trung Quốc (CAS),Viện động vật học, và các Viện khác đã thực hiện thành công việc giải toàn bộ trình tự genome của Locusta migratoria (locust), một trong những loài châu chấu (locust) có phổ lan rộng mạnh mẽ nhất. Toàn bộ genome có kích thước 6.5 gigabytes, là bộ genome lớn nhất của côn trùng được giải trình tự cho đến nay. Kết quả mới nhất được công bố trên tạp chí Nature Communications. Họ tiến hành giải trình tự bộ gen theo phương pháp “next-generation sequencing technology”, với cơ sở dữ liệu khổng lồ 721Gb, bao phủ gấp 114 lần của kích thước genome châu chấu 6.3Gb. Họ đã tiến hành chú thích trên bộ gen (annotation) và dự báo có 17.307 kiểu gen (gene models), phân lập trên 2.639 các họ gen có tính chất lập lại. Họ còn khám phá rằng có mười họ gen đứng đầu (top ten repeat families) chỉ đại diện cho 10% toàn bộ trình tự genome cho thấy không có những họ gen biểu hiện tính chất “dominant” trong genome con châu chấu (L. migratoria). Xem BGI's news

http://www.genomics.cn/en/news/show_news?nid=99886.

Hoặc http://www.nature.com/ncomms/2014/140114/ncomms3957/full/ncomms3957.html.

Tập thể nhà nghiên cứu thông báo trình tự bộ gen của trâu nước

Một nhóm nhà khoa học của Bangladesh và Trung Quốc đã thông báo rằng họ đã hoàn thành việc giải trình tự bộ gen con trâu (water buffalo) và phân tích có tính chất tin sinh học. Công trình khoa học quan trọng này đã đặt nền tảng cho phương pháp chọn giống nhờ phân tử (molecular breeding) con trâu nước, và đưa ra ánh sáng những hiểu biết của nhân loại về nguốn gốc và sự tiến hóa của con trâu trong quá trình thuần hóa. Đó là nổ lực hợp tác của Lal Teer Livestock Limited và BGI cho ra một công trình hoàn chỉnh và đồ sộ về genome của con trâu với toàn bộ bộ gen 2,77Gb, nhỏ hơn bộ gen người một chút. Họ đã tìm thấy có 21.550 gen mã hóa protein và so sánh với các chuỗi trình tự của các động vật có vú khác để phát hiện thêm những đặc điểm về di truyền và những thông báo hướng dẫn cho chương trình lai tạo giống, cũng như công nghệ di truyền biến đổi gen trong tương lai.

Xem http://www.genomics.cn/en/news/show_news?nid=99907.

Thông Báo

Genomics Research 2014

Hội Nghị Nghiên Cứu Genomic 2014 được tổ chức bởi Select Biosciences LTd., với sự tập trung giới thiệu single cell PCR, qPCR trong chẩn đoán, kỹ thuật sequencing thế hệ mới, microRNA-based gene expression và epigenetics. Hội nghị sẽ diễn ra tại South San Francisco Conference Center, California, USA vào ngày 29-30 tháng Tư, 2014.

Xem chi tiết  http://selectbiosciences.com/conferences/index.aspx?conf=gr2014.

Indian Seed Congress 2014

Đại Hội Hạt Giống Ấn Độ lần Thứ Năm được tổ chức bởi NSAI (National Seed Association of India),vào ngày 18 –19 tháng Hai 2014 tại Gujarat, Ấn Độ. Chủ đề của Đại Hội là ‘Seeds for Vibrant Agriculture'. Đăng ký tham dự trên mạng http://nsai.co.in/isc/registration-details.html hoặc xem chi tiết tại http://nsai.co.in/isc/