Giải trình tự bộ gen đầu tiên của mận Trung Quốc
Thứ hai, 31-12-2012 | 00:40:33
|
Một nhóm nghiên cứu của Trung Quốc, dẫn đầu bởi Đại học Lâm nghiệp Bắc Kinh, BGI, công ty TNHH Lin Fu Ke Yuan Bắc Kinh, và các viện khác, đã hoàn thành giải trình tự bộ gen đầu tiên của Prunus mume.
Công trình nghiên cứu này là vô cùng quan trọng đối với sự hiểu biết sâu sắc hơn về sự tiến hóa của họ Rosaceae và cung cấp một nguồn vô cùng giá trị cho việc cải thiện các cây ăn quả. Nghiên cứu mới nhất được công bố trực tuyến ngày 27 tháng 12 trên Nature Communication.
Là một trong những cây ăn quả có hoa lâu đời nhất, P. mume được thuần hóa ở Trung Quốc cách đây hơn 3.000 năm. Nó thuộc họ Rosaceae, họ thực vật có tầm quan trọng về mặt kinh tế đứng thứ ba ở các vùng ôn đới, đặc trưng bởi giá trị dinh dưỡng cao, giá trị về y tế, và khả năng chịu nhiệt độ thấp vào mùa đông. Sự sẵn có của bộ gen P. mume sẽ mở ra một phương pháp mới để giải mã tốt hơn những bí ẩn của loài cây này. Kỹ thuật trồng trọt khiến cho loài P. mume rất đa dạng – kỹ thuật ghép nhân tạo - cũng làm cho bộ gen của chúng trở nên khó khăn để ráp lại. Trong nghiên cứu này, các nhà nghiên cứu đã giải trình tự bộ gen của P. mume, một loài thực vật hoang dã từ Tây Tạng ở Trung Quốc, bằng cách sử dụng một cách tiếp cận tích hợp với trình tự thế hệ kế tiếp (NGS) và công nghệ lập bản đồ toàn bộ bộ gen (WGM). Sau đó, họ xây dựng một bản đồ di truyền với mật độ cao bằng cách áp dụng biện pháp chỉ dấu AND liên kết vị trí giới hạn (RAD) tiếp tục cải thiện chất lượng của các tham khảo gen. Thông qua những nỗ lực này, các nhà nghiên cứu tạo ra khoảng 237Mb bộ gen tham khảo P. mume. Độ phân giải hệ thống phát sinh loài hạn chế của Rosaceae cho thấy sự phát triển nhanh chóng của các loài trong họ. Trong nghiên cứu này, việc phân tích tiến hóa của bộ gen P. mume chứng minh rằng không có sao chép toàn bộ hệ gen (WGD) xảy ra sau khi phân hóa giữa P. mume và Malus x domestica (táo). Tuy nhiên, việc bố trí sắp xếp gen nhân ba đã được tìm thấy trong bộ gen P. mume.
Được hỗ trợ bởi các dữ liệu về gen của táo và dâu tây (Fragaria vesca), các nhà nghiên cứu đã xây dựng lại thành công chín nhiễm sắc thể tổ tiên của họ Rosaceae, và phân tích hợp nhất nhiễm sắc thể, quá trình tách và nhân đôi trong ba phân họ lớn, bao gồm các chi Prunus, Malus và Fragaria. Thông qua phân tích, nhóm nghiên cứu đưa ra giả thuyết rằng ít nhất 11 sự tách đôi và 11 hợp nhất xảy ra ở P. mume từ chín nhiễm sắc thể tổ tiên chung. Đối với táo, ít nhất một WGD và năm hợp nhất đã diễn ra để đạt được cấu trúc 17nhiễm sắc thể, so với 15 hợp nhất ở dâu tây ảnh hưởng đến cấu trúc nhiễm sắc thể 7.
Khả năng kháng bệnh liên quan đến gen có thể mang lại lợi ích cho việc cải thiện giống trong tương lai. Trong nghiên cứu này, các nhà nghiên cứu đã tìm thấy nhiều gen liên quan phát triển trong các bộ gen P. mume, chẳng hạn như gen leucine-rich repeat receptor-like kinase (LRR-RLK), các gen kháng mã hóa kết hợp với nucleotide (NBS-R gen mã hóa ), và nhóm gien liên quan đến phát sinh bệnh (PR). PR protein được báo cáo là có thể làm trung gian bảo vệ cây trồng chống lại liên kết gây bệnh và thích ứng với môi trường căng thẳng. Hầu hết các nhóm PR gien ở P. mume đã được mở rộng đáng chú ý đặc biệt là PR10, mở ra một sự phát triển có thể được liên quan đến phản ứng của P. mume với mặn và hạn hán, nhiễm nấm ở rễ và lá.
N.H. - Mard, Theo Sciencedaily.
|
Trở lại In Số lần xem: 1805 |
[ Tin tức liên quan ]___________________________________________________
|