Chào mừng Quý độc giả đến với trang thông tin điện tử của Viện Khoa học Kỹ thuật Nông nghiệp miền Nam

Tin nổi bật
Thành tích

Huân chương Ðộc lập

- Hạng 1 - Hạng 2 - Hạng 3

Huân chương Lao động

- Hạng 1 - Hạng 2 - Hạng 3

Giải thưởng Nhà nước

- Nghiên cứu dinh dưởng và thức ăn gia súc (2005)

- Nghiên cứu chọn tạo và phát triển giống lúa mới cho xuất khẩu và tiêu dùng nội địa (2005)

Giải thưởng VIFOTEC

- Giống ngô lai đơn V2002 (2003)

- Kỹ thuật ghép cà chua chống bệnh héo rũ vi khuẩn (2005)

- Giống Sắn KM 140 (2010)

Trung tâm
Liên kết website
lịch việt
Thư viện ảnh
Video
Giải pháp nâng cao hiệu quả sản xuất cây cà phê Việt Nam

Thống kê truy cập
 Đang trực tuyến :  16
 Số lượt truy cập :  17005619
Bản đồ di truyền và chỉ thị phân tử trong trường hợp gen kháng phổ rộng bệnh đạo ôn của cậy lúa, GEN Pi65(t), thông qua kỹ thuật NGS
Thứ sáu, 13-05-2016 | 08:11:53

Nguồn: Wenjing Zheng, Yan Wang, Lili Wang, Zuobin Ma, Jiaming Zhao, Ping Wang, Lixia Zhang, Zhiheng Liu, Xiaochun Lu. 2016. Genetic mapping and molecular marker development for Pi65(t), a novel broad-spectrum resistance gene to rice blast using next-generation sequencing. Theoretical and Applied Genetics, May 2016; Volume 129, Issue 5, pp 1035-1044

TÓM TẮT

Thông tin chính

Một gen kháng R mới vừa được lập bản đồ di truyền tại một locus, định vị trên nhiễm sắc thể 11, thuộc quãng giữa 30,42 – 30,85 Mb, đoạn phân tử này được người ta chứng minh rằng đó là nơi có hiệu quả trong cải tiến tính kháng bệnh đạo ôn cây lúa.

Tóm tắt

Bệnh đạo ôn lúa là một bệnh hại do vi nấm có mặt khắp toàn cầu. Sử dụng gen kháng R là cách tiếp cận quan trọng nhất để kiểm soát bệnh đạo ôn trong lai tạo giống lúa. Theo nghiên cứu này, người ta đã thực hiện kỹ thuật lập bản đồ phân giải cao với gen mới phát hiện Pi65(t), liên quan đến kết quả kháng bệnh đạo ôn phổ rộng đối với nấm Magnaporthe oryzae, thông qua phân tích “bulked segregant” kết hợp với kỹ thuật NGS (next-generation sequencing). Phân ly trong quần thể lưỡng bội kép (DH) và quần thể hồi giao BC1F2 cho thấy tính kháng đạo ôn của giống lúa Gangyu129 là do một gen đơn trội, ký hiệu là Pi65(t); định vị trên nhiễm sắc thể 11 ở quãng giữa 30,20 – 31,20 Mb theo kết quả NGS. Sau khi thanh lọc con lai tái tổ hợp (recombinants) với những chỉ thị phân tử vừa được phát triển, vùng mục tiêu này được thu hẹp lại còn 0,43 Mb, định vị giữa hai chỉ thị kế cận SNP-2SNP-8 tại vị trí vật lý thuộc quãng giữa 30,42 – 30,85 Mb khi tham chiếu với cơ sở dữ liệu của giống Nipponbare tại “build 5”. Sử dụng phần mềm QTL IciMapping, gen Pi65(t) được lập bản đồ phân giải cao ở locus thuộc quãng giữa chỉ thị InDel-1SNP-4 có khoảng cách di truyền là 0,11cM với InDel-1 và 0,98 cM với SNP-4. Giữa vùng ấy, bốn gen dự kiến đã được tìm thấy với các domain NBS (nucleotide binding site) và LRR (leucine-rich repeat). Người ta đã phát triển những chỉ thị phân tử để đánh giá kiểu gen của 305 dòng DH và tìm thấy chỉ thị InDel-1 liên kết rất gần với gen Pi65(t). Sử dụng chỉ thị InDel-1, người ta thấy giống lúa mới Chuangxin1 có chứa gen này và phát triển nó trong sản xuất, giống lúa ấy biểu hiện tính kháng cao với đạo ôn và đạt năng suất cao tại tỉnh Liaoning, Trung Quốc. Như vậy gen Pi65(t) có thể đóng vai trò quan trọng trong tính kháng bệnh đạo ôn của cây lúa.

 

Xem: http://link.springer.com/article/10.1007/s00122-016-2681-7

 

Hình 3: Đánh giá kiểu gen theo phần mềm “graphic” các dòng con lai tái tổ hợp trên cơ sở quét vùng chứa gen Pi65(t) bằng chỉ thị SNP-1 – SNP-9. Thanh đen đậm và vùng du nhập gen từ giống Ganggu128 (R). Thanh trắng là genome của giống Liaoxing1 (S). Chín SNP markers định vị trên bản đồ vật lý. Số theo sau marker là khoảng cách vật lý tính từ đỉnh NST 11 trở đi (tham chiếu cơ sở dữ liệu của Nipponbare trong “build 5”). Sáu đoạn tái tổ hợp được tìm thấy trong vùng chứa 9 marker đa hình này. Recombinant-1 từ sự quấn chéo giữa SNP-7 và SNP-8 với một kiểu hình kháng. Recombinant-2 và 4 từ sự quấn chéo giữa SNP-2 và SNP-3 với một kiểu hình kháng và một kiểu hình nhiễm, theo thứ tự. Recombinat-3 và 5 từ sự quấn chéo giữa SNP-8 và SNP-9 với một kiểu hình kháng và một kiểu hình nhiễm, theo thứ tự. Recombinant-6 từ sự quấn chéo giữa SNP-1 và SNP-2 với một kiểu hình kháng. Những dòng recombinants này cho thấy locus Pi65(t) nằm trong một quãng của NST 11 xác định bởi hai chỉ thị kế cận là SNP-2 (30,42 Mb) và SNP-8 (30,85 Mb)

 

GS. Bùi Chí Bửu lược dịch.

Trở lại      In      Số lần xem: 1686

[ Tin tức liên quan ]___________________________________________________
  • Bản đồ QTL chống chịu mặn của cây lúa thông qua phân tích quần thể phân ly trồng dồn của các dòng con lai tái tổ hợp bằng 50k SNP CHIP
  • Tuần tin khoa học 479 (16-22/05/2016)
  • Áp dụng huỳnh quang để nghiên cứu diễn biến sự chết tế bào cây lúa khi nó bị nhiễm nấm gây bệnh đạo ôn Magnaporthe oryzae
  • Vai trò của phân hữu cơ chế biến trong việc nâng cao năng năng suất và hiệu quả kinh tế cho một số cây ngắn ngày trên đất xám đông Nam Bộ
  • Tuần tin khoa học 475 (18-24/04/2016)
  • Vi nhân giống cây măng tây (Asparagus officinalis L.)
  • Thiết lập cách cải thiện sản lượng sắn
  • Nghiên cứu xây dựng hệ thống dự báo, cảnh báo hạn hán cho Việt Nam với thời hạn đến 3 tháng
  • Liệu thủ phạm chính gây nóng lên toàn cầu có giúp ích được cho cây trồng?
  • Tuần tin khoa học 478 (09-15/05/2016)
  • Sinh vật đơn bào có khả năng học hỏi
  • Côn trùng có thể tìm ra cây nhiễm virus
  • Bản đồ QTL liên quan đến tính trạng nông học thông qua quần thể magic từ các dòng lúa indica được tuyển chọn
  • Nghiên cứu khẳng định số loài sinh vật trên trái đất nhiều hơn số sao trong giải ngân hà chúng ta
  • Cơ chế di truyền và hóa sinh về tính kháng rầy nâu của cây lúa
  • Vật liệu bọc thực phẩm ăn được, bảo quản trái cây tươi hơn 7 ngày mà không cần tủ lạnh
  • Giống đậu nành chống chịu mặn có GEN gmst1 làm giảm sự sinh ra ROS, tăng cường độ nhạy với ABA, và chống chịu STRESS phi sinh học của cây Arabidopsis thaliana
  • Khám phá hệ giác quan cảm nhận độ ẩm không khí ở côn trùng
  • Phương pháp bền vững để phát triển cây lương thực nhờ các hạt nano
  • Các nhà khoa học khám phá mắt xích còn thiếu trong quá trình cố định đạm thực vật
Designed & Powered by WEBSO CO.,LTD