Xác định virus thuộc chi Begomovirus gây bệnh vàng xoăn lá trên cây cà chua (Solanum lycopersicum) ở tỉnh Lâm Đồng (ThS. Bùi Thị Thu Ngân, Email: ngan.btt@iasvn.org) | Vien Khoa Hoc Ky Thuat Nong Nghiep Mien Nam

Luận văn thạc sỹ

Xác định virus thuộc chi Begomovirus gây bệnh vàng xoăn lá trên cây cà chua (Solanum lycopersicum) ở tỉnh Lâm Đồng (ThS. Bùi Thị Thu Ngân, Email: ngan.btt@iasvn.org)

Thứ năm, 22-11-2012 | 13:17:52

TÓM TẮT

Đề tài nghiên cứu“ Xác định virus thuộc chi Begomovirus gây bệnh vàng xoăn lá trên cây cà chua (Solanum lycopersicum) ở tỉnh Lâm Đồng ” được tiến hành từ tháng 04/2009 đến tháng 12/2010 tại phòng Công nghệ Sinh học của Viện Khoa học kỹ thuật Nông nghiệp miền Nam. Mục tiêu của nghiên cứu là xác định được loài virus gây bệnh vàng xoăn lá trên cây cà chua ở tỉnh Lâm Đồng.

Nghiên cứu đã tiến hành điều tra tình hình bệnh vàng xoăn lá cà chua của 40 hộ trồng cà chua (34 hộ ở huyện Đơn Dương và 6 hộ ở huyện Đức Trọng) thuộc tỉnh Lâm Đồng và thu thập được 200 mẫu lá cây cà chua (mỗi hộ thu thập năm mẫu). Qua kết quả điều tra cho thấy có mười mẫu có biểu hiện bị bệnh, chiếm tỷ lệ 5%.

Nghiên cứu đã tiến hành ly trích DNA theo quy trình của Doyle và Doyle (1999) có điều chỉnh phù hợp với điều kiện phòng thí nghiệm thực hiện đề tài, thu được DNA có độ tinh sạch đạt yêu cầu (tỷ số OD 260/280 là 1,72). Thiết kế được hai cặp mồi dùng để khuyếch đại hai đoạn DNA thuộc vùng gen CP và gen Ren (cặp mồi TYLC-F1/TYLC-R1 khuyếch đại đoạn DNA có kích thước 750 bp và cặp mồi TYLC-F2/TYLC-R2 khuyếch đại đoạn DNA có kích thước 512 bp). Đã tối ưu hóa được quy trình phát hiện bệnh vàng xoăn lá cà chua bằng kỹ thuật PCR với nhiệt độ bắt cặp là 53⁰C trong thời gian 45 giây và nồng độ mồi là 0,4 μM tương ứng với cặp mồi TYLC-F1/TYLC-R1 và nhiệt độ bắt cặp là 52⁰C trong thời gian 30 giây và nồng độ mồi là 0,4 μM tương ứng với cặp mồi TYLC-F2/TYLC-R2.

Trong số 200 mẫu được xét nghiệm bằng kỹ thuật PCR, kết quả có 30 mẫu dương tính với Begomovirus chiếm tỷ lệ 15%. Kết quả này cho thấy phát hiện bệnh bằng kỹ thuật PCR cho kết quả chính xác hơn phương pháp quan sát bệnh bằng triệu chứng.

Hai mẫu dương tính với Begomovirus tương ứng với mỗi cặp mồi được chọn để giải trình tự. Kết quả giải trình tự được sử dụng để phân tích đặc điểm di truyền của virus nghiên cứu. Độ tương đồng về trình tự và sơ đồ phân nhóm di truyền của mẫu nghiên cứu và 17 chủng đại diện của mười loài Begomovirus liên quan đến bệnh vàng xoăn lá được xây dựng bằng phần mềm BioEdit, DNAstar và MEGA 4.1. Kết quả cho thấy mẫu nghiên cứu có độ tương đồng về trình tự với các chủng Việt Nam là 75% đến 99% và chủng trên thế giới từ 68% đến 94%. Trong đó, mẫu nghiên cứu có mối quan hệ gần gũi với các chủng thuộc loài TYLCKaV xuất hiện ở Thái Lan và Việt Nam với hệ số tương đồng là 94% - 99%.

Trở lại

Số lần xem: 5929

[ Tin tức liên quan ]___________________________________________________

Đang trực tuyến : 31
Số lượt truy cập : 34809119