Chào mừng Quý độc giả đến với trang thông tin điện tử của Viện Khoa học Kỹ thuật Nông nghiệp miền Nam

Tin nổi bật
Thành tích

Huân chương Ðộc lập

- Hạng 1 - Hạng 2 - Hạng 3

Huân chương Lao động

- Hạng 1 - Hạng 2 - Hạng 3

Giải thưởng Nhà nước

- Nghiên cứu dinh dưởng và thức ăn gia súc (2005)

- Nghiên cứu chọn tạo và phát triển giống lúa mới cho xuất khẩu và tiêu dùng nội địa (2005)

Giải thưởng VIFOTEC

- Giống ngô lai đơn V2002 (2003)

- Kỹ thuật ghép cà chua chống bệnh héo rũ vi khuẩn (2005)

- Giống Sắn KM 140 (2010)

Trung tâm
Liên kết website
lịch việt
Thư viện ảnh
Video
Thiết lập chuỗi giá trị nông sản thông minh và an toàn tại Việt Nam Cà chua bi

Thống kê truy cập
 Đang trực tuyến :  30
 Số lượt truy cập :  33491672
Công cụ phân tích tiết lộ thêm đa dạng di truyền thực vật
Thứ hai, 08-04-2024 | 06:26:57

Các nhà nghiên cứu đã phát triển một công cụ tính toán mới được thiết kế để thể hiện sự đa dạng di truyền trong cơ sở dữ liệu ADN của các loài thực vật khác nhau một cách nhanh chóng và hiệu quả. Đây được xem là một bước tiến lớn của khoa học nông nghiệp.

 

 

Ảnh minh họa

 

Nền tảng nguồn mở sẵn có giúp đẩy nhanh việc khám phá các biến thể di truyền vốn là chìa khóa để phát triển cây trồng với khả năng phục hồi, năng suất và giá trị dinh dưỡng được cải thiện.

 

Khai thác các thuật toán tiên tiến và khả năng tính toán hiệu năng cao (HPC), nhóm nhà khoa học nghiên cứu gen thực vật từ Đại học Khoa học Công nghệ King Abdullah (KAUST) đã chứng minh khả năng của công cụ này trong việc phát hiện những khác biệt nhỏ về DNA – cái gọi là các biến thể nucleotide đơn (SNP) – trên nhiều chủng vi khuẩn khác nhau. gạo, ngô, đậu tương và lúa miến.

 

Đơn cử như, trong trường hợp cây lúa, nhóm nghiên cứu đã sử dụng công cụ này trên một bộ dữ liệu di truyền phức tạp gồm các chuỗi ADN từ hàng nghìn phần khác nhau – một “bộ gen toàn diện” mà các nhà nghiên cứu trước đây đã giúp sắp xếp cho cây lúa châu Á (Oryza.sativa). Sử dụng tập dữ liệu này cùng với phương pháp phân tích mới, các nhà nghiên cứu của KAUST đã phát hiện ra hơn 2 triệu biến thể di truyền trước đây bị bỏ qua bởi các cuộc thẩm vấn thông thường đối với một bộ gen lúa tham chiếu duy nhất.

 

Các nhà nghiên cứu cho rằng diều này đánh dấu bước khởi đầu hướng tới mở ra những con đường mới trong cải tiến cây trồng và nông nghiệp bền vững. Những SNP ẩn này hiện có thể được sử dụng ngay lập tức cho các chương trình nhân giống và cũng để xác định các gen chức năng mới cho các đặc tính nông nghiệp.

 

Việc phát hiện ra SNP theo cách này cũng có thể giúp tiết lộ các mối liên hệ di truyền và tiến hóa giữa các dòng lúa khác nhau. Gần đây, các nhà khoa học đã dẫn đầu việc tạo ra bộ gen tham chiếu chất lượng cao cho lúa đỏ Hassawi, một loại cây trồng bản địa của Ả Rập Saudi được biết đến với khả năng phục hồi trước điều kiện hạn hán và độ mặn cao tại địa phương. Bằng cách sử dụng công cụ này, các nhà nghiên cứu có thể thiết lập mối liên hệ di truyền giữa lúa Hassawi và một phân nhóm lúa bao gồm các giống có nguồn gốc từ Úc, Ấn Độ và một số vùng ở Đông Nam Á.

 

Chìa khóa cho hiệu suất của công cụ - được đặt tên là quy trình gọi biến thể bộ gen tính toán hiệu suất cao hoặc HPC-GVCW - là khả năng chia các phần lớn của bộ gen thành các bit rời rạc và sau đó dựa vào các công nghệ xử lý song song để giải quyết các vấn đề điện toán phức tạp. trên dữ liệu gen đa chiều quy mô lớn.

 

Với việc ngày càng có nhiều bộ gen được sắp xếp theo trình tự, tác giả nghiên cứu kỳ vọng công cụ mới này sẽ chứng tỏ được giá trị vô giá trong việc hợp lý hóa hoạt động phân tích nhằm hỗ trợ nhân giống cây trồng thế hệ tiếp theo.

 

L.A - Mard, theo Sciencedaily

 

Trở lại      In      Số lần xem: 132

[ Tin tức liên quan ]___________________________________________________
  • Bản đồ di truyền và chỉ thị phân tử trong trường hợp gen kháng phổ rộng bệnh đạo ôn của cây lúa, GEN Pi65(t), thông qua kỹ thuật NGS
  • Bản đồ QTL chống chịu mặn của cây lúa thông qua phân tích quần thể phân ly trồng dồn của các dòng con lai tái tổ hợp bằng 50k SNP CHIP
  • Tuần tin khoa học 479 (16-22/05/2016)
  • Áp dụng huỳnh quang để nghiên cứu diễn biến sự chết tế bào cây lúa khi nó bị nhiễm nấm gây bệnh đạo ôn Magnaporthe oryzae
  • Vai trò của phân hữu cơ chế biến trong việc nâng cao năng năng suất và hiệu quả kinh tế cho một số cây ngắn ngày trên đất xám đông Nam Bộ
  • Tuần tin khoa học 475 (18-24/04/2016)
  • Vi nhân giống cây măng tây (Asparagus officinalis L.)
  • Thiết lập cách cải thiện sản lượng sắn
  • Nghiên cứu xây dựng hệ thống dự báo, cảnh báo hạn hán cho Việt Nam với thời hạn đến 3 tháng
  • Liệu thủ phạm chính gây nóng lên toàn cầu có giúp ích được cho cây trồng?
  • Tuần tin khoa học 478 (09-15/05/2016)
  • Sinh vật đơn bào có khả năng học hỏi
  • Côn trùng có thể tìm ra cây nhiễm virus
  • Bản đồ QTL liên quan đến tính trạng nông học thông qua quần thể magic từ các dòng lúa indica được tuyển chọn
  • Nghiên cứu khẳng định số loài sinh vật trên trái đất nhiều hơn số sao trong giải ngân hà chúng ta
  • Cơ chế di truyền và hóa sinh về tính kháng rầy nâu của cây lúa
  • Vật liệu bọc thực phẩm ăn được, bảo quản trái cây tươi hơn 7 ngày mà không cần tủ lạnh
  • Giống đậu nành chống chịu mặn có GEN gmst1 làm giảm sự sinh ra ROS, tăng cường độ nhạy với ABA, và chống chịu STRESS phi sinh học của cây Arabidopsis thaliana
  • Khám phá hệ giác quan cảm nhận độ ẩm không khí ở côn trùng
  • Phương pháp bền vững để phát triển cây lương thực nhờ các hạt nano
Designed & Powered by WEBSO CO.,LTD