Chào mừng Quý độc giả đến với trang thông tin điện tử của Viện Khoa học Kỹ thuật Nông nghiệp miền Nam

Tin nổi bật
Thành tích

Huân chương Ðộc lập

- Hạng 1 - Hạng 2 - Hạng 3

Huân chương Lao động

- Hạng 1 - Hạng 2 - Hạng 3

Giải thưởng Nhà nước

- Nghiên cứu dinh dưởng và thức ăn gia súc (2005)

- Nghiên cứu chọn tạo và phát triển giống lúa mới cho xuất khẩu và tiêu dùng nội địa (2005)

Giải thưởng VIFOTEC

- Giống ngô lai đơn V2002 (2003)

- Kỹ thuật ghép cà chua chống bệnh héo rũ vi khuẩn (2005)

- Giống Sắn KM 140 (2010)

Trung tâm
Liên kết website
lịch việt
Thư viện ảnh
Video
Thiết lập chuỗi giá trị nông sản thông minh và an toàn tại Việt Nam Cà chua bi

Thống kê truy cập
 Đang trực tuyến :  7
 Số lượt truy cập :  33462028
Giải mã bộ gen virus gây bệnh khảm trên sắn (cassava mosaic disease)
Thứ tư, 04-12-2013 | 08:08:20

Công trình của Oteng-Frimpong và ctv. (2012), ĐH  Ghana, Legon, Ghana đã giải mã trình tự virus gây bệnh khảm trên sắn. Bệnh này do caused một hoặc tập họp các “cassava mosaic geminiviruses” gây ra. Đây là bệnh gây thiệt hại năng suất sắn nghiêm trọng trên thế giới. Sử dụng enzymes có tính chất độc nhất và có khả năng khuếch đại theo chu kỳ khép kín, toàn bộ genome của hai loài geminivirus đã được giải mã từ những cây sắn bị bệnh ở Ghana, chúng được dòng hóa trong plasmid pCambia 1300pET-28b. Trình tự của những genomes này được xác định trên máy ABI sequencer và người ta thực hiện so sánh “pairwise” với những geminiviruses khác trên cây sắn bị nhiễm bệnh tại nhiều nước khác nhau.

 

Người ta phân ra:

  1. African cassava mosaic virus (ACMV)
  2. East African cassava mosaic virus (EACMV)-like

Chúng có mức độ giống nhau theo chuỗi trình tự khá cao 94% trong nhóm 1 và 80% trong nhóm 2, trên cơ sở so sánh thành phần DNA-A và DNA-B của từng virus.

 

Mức độ giống nhau là 66% ở CR của A (common region) và 41% ở CR của B.

 

Phân tử DNA-A của ACMV và EACMV-like chứa 2781 và 2800 nucleotides, theo thứ tự. Thành phần của DNA-A và DNA-B có 2725 và  2734 nucleotides, theo thứ tự.

 

 

Hình 2: Cây gia hệ (1000 boot strap replications) thể hiện mối quan hệ của “toàn bộ trình tự DNA-A”  giữa những mẫu phân lập của geminivirus (màu xanh dương) với mosaic geminiviruses khác.

 

TGMV-YV Tomato golden mosaic virus. ACMV-[CI]: African cassava mosaic virus-[Côte d'Ivoire] (AF259894); ACMV-[NG/Ogo], African cassava mosaic virus-[Nigeria-Ogo] (AJ427910); ACMV-[CM/D02], African cassava mosaic virus-[Cameroon D02] (AF366902); ACMV-[CM/D03], African cassava mosaic virus-[Cameroon D03] (AY211885); ACMV-[CM/Mg], African cassava mosaic virus-[Cameroon Mg] (AY211884); ACMV-[CM], African cassava mosaic virus-[Cameroon] (AF112352); ACMV-[KE], African cassava mosaic virus-[Kenya] (J02057); ACMV-[NG], African cassava mosaic virus-[Nigeria] (X17095); ACMV-UGMld, African cassava mosaic virus-Uganda mild (AF126800); ACMV-UGSvr, African cassava mosaic virus-Uganda severe (AF126802); EACMCV-[CM/KO], East African cassava mosaic Cameroon virus-[Cameroon KO] (AY211887); EACMCV-[CM], East African cassava mosaic Cameroon virus-[Cameroon] (AF112354); EACMCV-[CI], East African cassava mosaic Cameroon virus-[Côte d'Ivoire] (AF259896); EACMMV-[K], East African cassava mosaic Malawi virus-[K] (AJ006460); EACMMV-[MH], East African cassava mosaic Malawi virus-[MH] (AJ006459); EACMV-[KE/k2B], East African cassava mosaic virus [Kenya-K2B] (AJ006458); EACMV-[TZ], East African cassava mosaic virus-[Tanzania] (Z53256); EACMV-UG2[2], East African cassava mosaic virus-Uganda2[2] (Z83257); EACMV-UG2Mld, East African cassava mosaic virus-Uganda2 mild (AF126804); EACMV-UG2Svr, East African cassava mosaic virus-Uganda2 severe (AF126806); EACMZV-[KE/Kil], East African cassava mosaic Zanzibar virus-[Kenya -Kil] (AJ516003); EACMZV-[ZB], East African cassava mosaic Zanzibar Virus – [Zanzibar] (AF422174); ICMV-[Adi2], Indian cassava mosaic virus – [Adivaram 2] (AJ575819); ICMV-[Mah], Indian cassava mosaic virus – [Maharashstra] (AJ314739); ICMV-[Mah2], Indian cassava mosaic virus – [Maharashstra 2] (AY730035); ICMV-[Tri], Indian cassava mosaic virus – [Trivandrum] (Z24758); SACMV-[M12], South African cassava mosaic virus-[Madagascar M12] (AJ422132); SACMV-[ZA], South African cassava mosaic virus – [South Africa] (AF155806); SACMV-[ZW], South African cassava mosaic virus – [Zimbabwe] (AJ575560); SLCMV-[Adi], Sri-Lankan cassava mosaic virus-[Adivaram] (AJ579307); SLCMV-[Col], Sri-Lankan cassava mosaic virus-[Colombo] (AF314737); SLCMV-[Sal], Sri-Lankan cassava mosaic virus-[Salem] (AJ607394).

Ndunguru et al. Virology Journal 2005 2:21   doi:10.1186/1743-422X-2-21

 

TÀI LIỆU THAM KHẢO

 

Oteng-Frimpong R, Levy Y, Torkpo SK, Danquah EY, Offei SK, Gafni Y. (2012). Complete genome sequencing of two causative viruses of cassava mosaic disease in Ghana. Acta Virol 56(4):305-314

 

Bùi chí Bửu lược dịch.

Trở lại      In      Số lần xem: 1904

[ Tin tức liên quan ]___________________________________________________
  • Bản đồ di truyền và chỉ thị phân tử trong trường hợp gen kháng phổ rộng bệnh đạo ôn của cây lúa, GEN Pi65(t), thông qua kỹ thuật NGS
  • Bản đồ QTL chống chịu mặn của cây lúa thông qua phân tích quần thể phân ly trồng dồn của các dòng con lai tái tổ hợp bằng 50k SNP CHIP
  • Tuần tin khoa học 479 (16-22/05/2016)
  • Áp dụng huỳnh quang để nghiên cứu diễn biến sự chết tế bào cây lúa khi nó bị nhiễm nấm gây bệnh đạo ôn Magnaporthe oryzae
  • Vai trò của phân hữu cơ chế biến trong việc nâng cao năng năng suất và hiệu quả kinh tế cho một số cây ngắn ngày trên đất xám đông Nam Bộ
  • Tuần tin khoa học 475 (18-24/04/2016)
  • Vi nhân giống cây măng tây (Asparagus officinalis L.)
  • Thiết lập cách cải thiện sản lượng sắn
  • Nghiên cứu xây dựng hệ thống dự báo, cảnh báo hạn hán cho Việt Nam với thời hạn đến 3 tháng
  • Liệu thủ phạm chính gây nóng lên toàn cầu có giúp ích được cho cây trồng?
  • Tuần tin khoa học 478 (09-15/05/2016)
  • Sinh vật đơn bào có khả năng học hỏi
  • Côn trùng có thể tìm ra cây nhiễm virus
  • Bản đồ QTL liên quan đến tính trạng nông học thông qua quần thể magic từ các dòng lúa indica được tuyển chọn
  • Nghiên cứu khẳng định số loài sinh vật trên trái đất nhiều hơn số sao trong giải ngân hà chúng ta
  • Cơ chế di truyền và hóa sinh về tính kháng rầy nâu của cây lúa
  • Vật liệu bọc thực phẩm ăn được, bảo quản trái cây tươi hơn 7 ngày mà không cần tủ lạnh
  • Giống đậu nành chống chịu mặn có GEN gmst1 làm giảm sự sinh ra ROS, tăng cường độ nhạy với ABA, và chống chịu STRESS phi sinh học của cây Arabidopsis thaliana
  • Khám phá hệ giác quan cảm nhận độ ẩm không khí ở côn trùng
  • Phương pháp bền vững để phát triển cây lương thực nhờ các hạt nano
Designed & Powered by WEBSO CO.,LTD